Résumé: Kyon est élève en 1ère année de lycée. Le jour de la rentrée, il se retrouve dans la même classe qu’ Haruhi Suzumiya, une étrange jeune fille au caractère excentrique. Comme la plupart des garçons du lycée, Kyon est attiré par Haruhi, mais ses amis Taniguchi et Kunikida le dissuadent de sortir avec elle. Et pour cause, il découvre une jeune fille au caractère extrêmement autoritaire, qui n’a qu’une passion dans la vie : le surnaturel. Alors que les humains l’ennuient, elle est persuadée que les extra-terrestres existent et rêve d’en découvrir et de les fréquenter. Elle décide donc de créer la Brigade SOS, un club dont le but est de rechercher tout ce qui a trait au paranormal. Kyon est enrôlé de force avec Yuki Nagato et Mikuru Asahina, deux jeunes filles du lycée. Afin de garantir le bon fonctionnement de son club et d’assurer un nombre maximum d’adhésions, Haruhi multiplie les stratagèmes et n’hésite pas à manipuler ses camarades. Itsuki Koizumi, un nouvel élève, se déclare fan des théories d’Haruhi et intègre la Brigade en cours d’année. Au contact des différents membres du club, Kyon va découvrir un nouveau monde et d’étranges vérités qui bouleverseront ses certitudes...